Sadržaj
Započnite postupak identifikacije nepoznatih bakterija promatrajući njihove fizičke karakteristike, poput stanične stijenke, oblika i veza. Koristite standardne laboratorijske postupke, poput bojanja stanica, kultiviranja i sekvenciranja DNA kako biste dodatno suzili vašu identifikaciju. Bakterije su općenito grupirane u vrste prema fizičkim i metaboličkim karakteristikama, a ne prema međusobnim genetskim odnosima.
Pozitivno ili negativno
Eubakterije su takozvane prave bakterije.Razlikuju se od arheje ili arhebakterija, koje tvore zasebno kraljevstvo. Eubakterije su prokarioti, što znači da im nedostaje nuklearna membrana. Većina ima stanične membrane i stanične stijenke. Bakterije s debelim staničnim stijenkama nazivaju se gram-pozitivne jer su osjetljive na umiranje tijekom testa zvanog Gram mrlja. Mrlja po Gramu prvi je test koji se koristio u klasifikaciji bakterija. Bakterije s tankim ili odsutnim staničnim stijenkama gram su negativne jer ne hvataju boju po Gramu mrljama.
Oblikovanje bakterija
Sferne bakterije nazivaju se cocci, bakterije koje tvore ravne šipke nazivaju se bacili, a bakterije s međusobnim oblikom nazivaju se coccobacilli. Sve ovo može biti gram-negativno ili gram-pozitivno. Krute, spiralno oblikovane bakterije poznate su pod nazivom spirila i samo su gram-negativne. Fleksibilne, neovisno pokretne, spiralno oblikovane bakterije nazivaju se spirohete i gram-neutralne su. Konačno, krute šipke u obliku zareza nazivaju se vibriomi i gram-negativne. Nekoliko malo poznatih i slabo razumljivih bakterija imaju različite oblike, poput zvijezda u obliku zvijezde i sjekirastih labrusa. Postoje i dvije srednje bakterijske skupine. Rickettsia su slični virusima, imaju različite oblike, gram su negativni i mogu preživjeti samo unutar drugih stanica. Mikoplazmi, koje su slične gljivicama, nedostaju stanične stijenke i uključuju mnoge plućne patogene uzrokovane upalom pluća.
Kocke, grozdovi i ostale veze
Koki i bacili se dalje klasificiraju prema vezama koje formiraju nakon diobe stanica. Diplokoki i diplobacili leže zajedno u paru. Streptokoki i streptobacili tvore lance. Tetradski koki ostaju na kvadratima četiri bakterije. Sarcinae koci formiraju kocku od osam bakterija, a stafilokoki formiraju grozdove.
Prepoznavanje bakterija
Ako imate nepoznatu bakteriju i želite je identificirati, obično obavljate gram mrlje, a zatim promatrate izgled kolonije i pojedinačne karakteristike. U tom trenutku možete reći da imate, na primjer, gram-negativne aerobne streptobacile. Zatim možete usporediti svoj uzorak s različitim poznatim bakterijama tako što ćete ga staviti na različite kulture kulture koje potiču rast nekih vrsta i inhibirati druge ili testiranjem uzorka na različite poznate bakterijske nusprodukte. Kao krajnje sredstvo, sekvenciranjem DNA može se utvrditi imate li poznatu ili nepoznatu bakterijsku vrstu ili soj, pod uvjetom da je uspoređujete sa vrstom ili sojem čiji je genom već sekvenciran.