Sadržaj
- TL; DR (Predugo; nisam pročitao)
- Opis Ribosoma
- Prevalencija Ribosoma
- Ribosomi su tvornica proteina
- Tko je otkrio ribosome?
- Otkriće građe ribosoma
- Što je ribozim?
- Razvrstavanje Ribosoma po Svedbergovim vrijednostima
- Važnost strukture Ribosoma
Ribosomi su poznati kao tvorci proteina svih stanica. Proteini kontroliraju i grade život.
Stoga su ribosomi bitni za život. Unatoč njihovom otkriću pedesetih godina prošlo je nekoliko desetljeća prije nego što su znanstvenici doista rasvijetlili strukturu ribosoma.
TL; DR (Predugo; nisam pročitao)
Ribosome, poznate kao tvornice proteina svih stanica, prvi je otkrio George E. Palade. Međutim, strukturu ribosoma desetljećima kasnije utvrdili su Ada E. Yonath, Thomas A. Steitz i Venkatraman Ramakrishnan.
Opis Ribosoma
Ribosomi su dobili svoje ime po "ribo" ribonukleinske kiseline (RNA) i "soma", što je latinsko za "tijelo".
Znanstvenici definiraju ribosome kao strukturu koja se nalazi u stanicama, jedan od nekoliko manjih staničnih podskupova organele, Ribosomi imaju dvije podjedinice, jednu veliku i jednu malu. Nukleolus čini ove podjedinice, koje se međusobno zaključavaju. Ribosomalna RNA i proteini (riboproteins) čine ribosom.
Neki ribosomi lebde među stanicama citoplazme, dok se drugi pričvršćuju na endoplazmatski retikulum (ER). Naziva se endoplazmatski retikulum ispunjen ribosomima grubi endoplazmatski retikulum (OIE); glatki endoplazmatski retikulum (SER) nema prikačen ribosom.
Prevalencija Ribosoma
Ovisno o organizmu, stanica može imati nekoliko tisuća ili čak milijuna ribosoma. Ribosomi postoje i u prokariotskim i u eukariotskim stanicama. Oni se mogu naći i u bakterijama, mitohondrijama i kloroplastima. Ribosomi su češći u stanicama koje zahtijevaju stalnu sintezu proteina, poput stanica mozga ili gušterače.
Neki ribosomi mogu biti prilično masivni. U eukariotama mogu imati 80 proteina i biti sastavljeni od nekoliko milijuna atoma. Njihova RNA porcija zauzima više mase nego proteinski dio.
Ribosomi su tvornica proteina
Ribosomi uzimaju kodona, koji su niz od tri nukleotida, iz messenger RNA (mRNA). Kodon služi kao predložak iz DNK ćelije da se napravi određeni protein. Ribosomi zatim prevode kodone i odgovaraju ih aminokiselini iz prijenos RNA (TRNA). To je poznato kao prijevod.
Ribosom ima tri mjesta za vezanje tRNA: an aminoacil mjesto vezanja (web mjesto) za vezivanje aminokiselina, a peptidne site (P site) i an Izlaz mjesto (E mjesto).
Nakon ovog postupka, prevedena aminokiselina gradi se na proteinskom lancu zvanom a polipeptid, sve dok ribosomi ne dovrše posao stvaranja proteina. Kad se polipeptid pusti u citoplazmu, on postaje funkcionalni protein. Zbog toga se zbog toga ribosomi često definiraju kao tvornice proteina. Tri faze proizvodnje proteina nazivaju se inicijacija, produženje i prevođenje.
Ti strojom ribosomi djeluju brzo, pridružujući se 200 aminokiselina u minuti u nekim slučajevima; prokarioti mogu dodati 20 aminokiselina u sekundi. Složeni proteini se sakupljaju nekoliko sati. Ribosomi čine većinu od oko 10 milijardi proteina u stanicama sisavaca.
Završeni proteini mogu zauzvrat podvrgnuti dodatnim promjenama ili savijanju; ovo se zove post-translacijska modifikacija, U eukariotama je Golgijev aparat dovršava protein prije nego što se oslobodi. Nakon što ribosomi završe s radom, njihove se podjedinice ili recikliraju ili demontiraju.
Tko je otkrio ribosome?
George E. Palade prvi je put otkrio ribosome 1955. godine. Paladeov opis ribosoma prikazao ih je kao citoplazmatske čestice koje su povezane s membranom endoplazmatskog retikuluma. Palade i drugi istraživači otkrili su funkciju ribosoma, a to je bila sinteza proteina.
Francis Crick nastavio bi s formiranjem središnja dogma biologije, koji je sažeo proces izgradnje života kao "DNK čini RNA čini protein."
Dok je opći oblik određen elektronskim mikroskopskim slikama, trebalo bi još nekoliko desetljeća da se utvrdi stvarna struktura ribosoma. To je u velikoj mjeri posljedica razmjerno ogromnoj veličini ribosoma, što je inhibiralo analizu njihove strukture u kristalnom obliku.
Otkriće građe ribosoma
Dok je Palade otkrio ribosom, drugi su znanstvenici utvrđivali njegovu strukturu. Tri odvojena znanstvenika otkrila su strukturu ribosoma: Ada E. Yonath, Venkatraman Ramakrishnan i Thomas A. Steitz. Ova tri znanstvenika nagrađena su Nobelovom nagradom za kemiju 2009. godine.
Otkrivanje trodimenzionalne strukture ribosoma dogodilo se 2000. godine. Yonath, rođen 1939. godine, otvorio je vrata ovoj objavi. Njezin početni rad na ovom projektu započeo je 1980-ih. Koristila je mikrobe iz vrućih izvora kako bi izolirala svoje ribosome, zbog robusne prirode u teškim uvjetima. Uspjela je kristalizirati ribosome tako da su se mogli analizirati rendgenskom kristalografijom.
To je generiralo obrazac točkica na detektoru tako da se mogu utvrditi položaji ribosomalnih atoma. Yonath je na kraju proizveo visokokvalitetne kristale koristeći kriokristalografiju, što znači da su ribosomalni kristali bili zamrznuti kako bi se spriječilo da se razgrade.
Znanstvenici su zatim pokušali rasvijetliti „fazni kut“ za uzorke točkica. Kako se tehnologija poboljšavala, usavršavanja postupka dovela su do detalja na razini jednog atoma. Steitz, rođen 1940., uspio je otkriti koji su reakcijski koraci uključivali koji atomi, na spojevima aminokiselina. Otkrio je podatke o fazama za veću jedinicu ribosoma 1998. godine.
Ramakrishan, rođen 1952. godine, zauzvrat je radio na rješavanju faze difrakcije rendgenskih zraka za dobru molekularnu kartu. Otkrio je podatke o fazi za manju podjedinicu ribosoma.
Danas su daljnji napredak u potpunoj kristalografiji ribosoma doveli do boljeg razrješavanja složenih struktura ribosoma. U 2010. godini, znanstvenici su uspješno kristalizirali eukariotske 80S ribosome Saccharomyces cerevisiae i bili su u mogućnosti preslikati njegovu strukturu rendgenskih zraka ("80S" je vrsta kategorizacije koja se naziva Svedbergova vrijednost; više o tome ukratko). To je zauzvrat dovelo do više informacija o sintezi i regulaciji proteina.
Ribosomi manjih organizama do sada su se pokazali kao najlakše raditi na određivanju strukture ribosoma. To je zato što su sami ribosomi manji i manje složeni. Potrebno je više istraživanja kako bi se utvrdilo strukture ribosoma viših organizama, poput onih u ljudi. Znanstvenici se također nadaju da će naučiti više o ribosomskoj strukturi patogena, kako bi se pomoglo u borbi protiv bolesti.
Što je ribozim?
Uvjet ribosom odnosi se na veću od dvije podjedinice ribosoma. Ribozim funkcionira kao enzim, otuda i njegovo ime. Služi kao katalizator u sastavljanju proteina.
Razvrstavanje Ribosoma po Svedbergovim vrijednostima
Svedbergove (S) vrijednosti opisuju brzinu taloženja u centrifugi. Znanstvenici često opisuju ribosomske jedinice pomoću Svedbergovih vrijednosti. Na primjer, prokarioti posjeduju 70S ribosoma koji se sastoje od jedne jedinice s 50S i jedne od 30S.
Oni se ne zbrajaju, jer brzina taloženja ima više veze s veličinom i oblikom nego s molekularnom težinom. Eukariotske stanice, s druge strane, sadrže 80S ribosoma.
Važnost strukture Ribosoma
Ribosomi su bitni za čitav život, jer čine proteine koji osiguravaju život i njegove sastavne dijelove. Neki esencijalni proteini za ljudski život uključuju hemoglobin u crvenim krvnim ćelijama, inzulin i antitijela, među mnogim drugima.
Jednom kada su istraživači otkrili strukturu ribosoma, otvorila je nove mogućnosti za istraživanje. Jedna takva mogućnost istraživanja namijenjena je novim lijekovima protiv antibiotika. Na primjer, novi lijekovi mogu zaustaviti bolest ciljajući određene strukturne komponente ribosoma bakterija.
Zahvaljujući strukturi ribosoma koje su otkrili Yonath, Steitz i Ramakrishnan, istraživači sada znaju precizne lokacije između aminokiselina i mjesta na kojima proteini napuštaju ribosome. Nula na mjestu gdje se antibiotici vežu za ribosome otvara mnogo veću preciznost u djelovanju lijeka.
To je presudno u vremenu u kojem su se prethodno uporni antibiotici susretali sa sojevima bakterija rezistentnih na antibiotike. Otkrivanje strukture ribosoma je stoga od velike važnosti za medicinu.