Sadržaj
Ribonukleinska kiselina, ili RNA, igra nekoliko vitalnih uloga u životu stanice. Djeluje kao glasnik, prenoseći genetski kod iz deoksiribonukleinske kiseline ili DNK u staničnu mašinu za sintezu proteina. Ribosomalna RNA spaja se sa proteinima kako bi tvorila ribosome, tvornice proteina ćelije. Prijenos RNA okida aminokiseline u rastuće proteinske lance dok ribosomi prevode mesnati RNA. Drugi oblici RNA pomažu u kontroli stanične aktivnosti. Enzim RNA polimeraza, ili RNAP, koji ima nekoliko oblika, odgovoran je za produženje lanca RNA tijekom transkripcije DNK.
Struktura RNK polimeraze
U eukariotskim stanicama - to jest ćelijama s organiziranim jezgrama - različiti tipovi RNAP-a označeni su od I do V. Svaka osoba ima malo drugačiju strukturu i svaka stvara različit skup RNA. Na primjer, RNAP II je odgovoran za stvaranje RNA glasnika, ili mRNA. Prokariotske stanice (koje nemaju organizirane jezgre) imaju jednu vrstu RNAP-a. Enzim se sastoji od nekoliko proteinskih podjedinica koje obavljaju različite funkcije tijekom transkripcije. Aktivno mjesto koje sadrži atom magnezija mjesto je u enzimu na kojem se RNA produžuje. Aktivno mjesto dodaje šećer-fosfatne skupine u rastući lanac RNA i veže nukleotidne baze u skladu s pravilima spajanja baza.
Spajanje baze
DNA je duga molekula s okosnicom sastavljenom od naizmjeničnih jedinica šećera i fosfata. Jedna od četiri nukleotidne baze - molekule s jednim ili dvostrukim prstenom, koje sadrže dušik, visi sa svake jedinice šećera. Četiri DNK baze su označene sa A, T, C i G. Slijed baznih parova duž molekule DNA diktira slijed aminokiselina u proteinima sintetiziranim u stanicu. DNK obično postoji kao dvostruka spirala u kojoj se baze dviju niti vežu jedna na drugu prema pravilima pariranja baza: A i T baze čine jedan par parova, dok C i G drugi skup. RNA je povezana jednolančana molekula koja poštuje ista pravila spajanja baza tijekom transkripcije DNK, osim zamjene U baze za T u RNA.
Inicijacija transkripcije
Faktori inicijacije proteina moraju formirati kompleks s molekulom RNA polimeraze prije nego što transkripcija može započeti. Ti faktori omogućuju vezanje enzima za promotorne regije - točke vezanja za različite jedinice transkripcije - na lancu DNA. Jedinice za transkripciju su sljedovi jednog ili više gena koji su proteinski specifični dijelovi lanca DNA. Kompleks RNA polimeraze stvara transkripcijski mjehurić otpakivanjem dijela dvostruke spirale DNA na početku jedinice za transkripciju. Enzimski kompleks tada započinje sastavljanje RNA čitanjem jednog sloja DNA uzorka.
Elongacija i raskid
Kompleks RNA polimeraze mogao bi pokrenuti mnogo lažnih pokretanja prije nego što započne produženje. Ako se lažno pokrene, enzim prepisuje oko 10 baza, a zatim prekida postupak i ponovno pokreće. Izdvajanje može početi tek kada RNAP oslobodi početne faktore proteina pričvršćujući ih na područje promotora DNA. Jednom kada je produženje produženo, enzim uključuje faktore izduženja kako bi pomogao pomicanju mjehurića za transkripciju niz DNK lanac. Pomična RNAP molekula produžuje novu nit RNA dodavanjem šećerno-fosfatnih jedinica i nukleotidnih baza koje nadopunjuju baze na DNK šabloni. Ako RNAP otkriva pogrešno osnovan osnov, može cijepati i ponovo sintetizirati neispravni RNA segment. Transkripcija se završava kada enzim očita zaustavni slijed na DNA obrascu. Po završetku, enzim RNAP oslobađa transkript RNK, proteinske faktore i DNK predložak.