Sadržaj
- Definicija genotipa
- Poznavajući genotip: Punnettov trg
- Lančana reakcija polimeraze
- Sonda za hibridizaciju
- Izravno sekvenciranje DNK
Pojam genotip odnosi se na kompletnu genetsku strukturu organizma. Također se koristi i za opisivanje različitih varijacija gena, poznatih kao aleli. Ljudi imaju dva alela za svaki genetski položaj, odnosno lokus.Uzeto zajedno, svaki par alela smatra se specifičnim genotipom.
Poznavanje genotipa ili primjera genotipa pojedinca može biti važno za razumijevanje genetske ekspresije, dijagnosticiranje bolesti, učenje o genetskim mutacijama i još mnogo toga.
Definicija genotipa
Počnimo s određenom definicijom genotipa. Genotip pojedinaca su nasljedne genetske informacije koje taj pojedinac posjeduje. To se odnosi na vaše gene, DNK, alele itd. Jednom sveobuhvatnom riječi. Primjer bi bio opis genotipa boje cvijeća kao RR (što znači da imaju dvije alele "crvene", RR, za svoju boju) ili Rr (jedan alel "crveni", R i jedan alel "ružičasti", r, za boju) ,
S druge strane, vaš je fenotip ono što i pojedinac fizički pokazuje one koje su određene genotipom koji imaju. Dok dvije jedinke mogu imati isti fenotip, mogu imati potpuno različite genotipove. Slijedom cvjetnog primjera, i RR i Rr cvjetovi bi bili crveni jer je crvena boja dominantna nad ružičastom. Međutim, oni se razlikuju u svom genotipu, jer je jedan homozigot (RR), a jedan heterozigot (Rr).
Pročitajte više o definiciji, alelima i primjerima genotipova.
Poznavajući genotip: Punnettov trg
Punnettov kvadrat jedan je od najjednostavnijih načina za određivanje genotipa. Trg je zapravo mini-grafikon koji se koristi za određivanje potencijalnog genotipa za potomstvo s obzirom na određenu osobinu.
Da biste stvorili Punnettov kvadrat, napišite sve moguće alele preko vrha kvadrata za jednog roditelja, a sve moguće alele za drugi roditelj dolje s lijeve strane. Svaki navedeni alel postat će ili stupac, za gornje alele ili red, za alele s lijeve strane, unutar kvadrata. Kvadrat se popunjava dok u njihove stupce upisujete alele s vrha, a zatim u njihove redove upisujete alele sa strane, stvarajući kvadrat prepun potencijalnih genotipova.
Primjer genotipa koji koristi kvadrat Punnetta su klasični eksperimenti s graškom, koje je izveo Gregor Mendel. Ovdje pogledajte konkretne primjere genotipa i Punnettove kvadrate.
Lančana reakcija polimeraze
Razvijena tijekom 1980-ih, lančana reakcija polimeraze (PCR) stvara specifičan sastojak DNA na temelju predloška. Pored lanca predloška, za PCR reakciju potrebni su DNA polimeraza, nukleotidi i kratki komadići jednolančane DNK.
U određenom trenutku PCR reakcija počinje generirati kopije eksponencijalno, a tek tijekom ove faze moguće je utvrditi izvornu količinu ciljane sekvence u uzorku. Metoda se koristi u svrhu sekvenciranja, kloniranja i genetskog inženjeringa.
Pročitajte više o razlikama između PCR kloniranja.
Sonda za hibridizaciju
Sonda za hibridizaciju koristi se za utvrđivanje da li je fizička karakteristika zbog genotipa. Proces započinje potpunom razgradnjom DNA koju treba analizirati, nakon čega slijedi njezin prijenos u filtrirajuću membranu. Zatim se sonda doda u filter i pusti da se veže za ciljni niz.
Nakon otprilike 24 sata, filter se ispere kako bi se uklonila svaka nevezana sonda. Probna hibridizacija također se može koristiti za utvrđivanje učinkovitosti postupka kloniranja ili otkrivanje broja kopija određenog gena.
Izravno sekvenciranje DNK
Projekt Ljudski genom doveo je do razvoja brojnih snažnih alata za sekvenciranje DNK. Pored dekodiranja kompletnog genoma Homo sapiens, ovi alati omogućili su znanstvenicima da slijede kompletne genome mnogih drugih organizama, uključujući miševe, štakore i rižu. Najsuvremeniji alati za sekvenciranje omogućuju današnjim genetičarima da brzo i jeftino uspoređuju i manipuliraju velikim količinama DNK.
To će omogućiti utvrđivanje uloge genetike u osjetljivosti na bolest, genetičkog odgovora organizama na podražaje iz okoliša i praćenja evolucije osobine ili vrste, prema Nacionalnom istraživačkom institutu za ljudski genom.